故事开始，阿U和他的小伙伴们发现他们看守的巨大超级萝卜突然变小了。博士怀疑是周围巨石阵的土壤中含有某种只对大萝卜有作用的特殊物质，而这些物质已经受到了破坏，导致大萝卜无法得到营养而开始萎缩。为了拯救大萝卜，博士推测周围岛屿上可能还存在同样的土壤，可以让大萝卜恢复原状。孩子们自愿承担了寻找土壤的任务，并得到了博士送来的智慧超群的机器人兔智的帮助。兔智不仅具有高超的智慧，还拥有各种能力，在保护萝卜的过程中发挥了关键作用。 自上映之后阿优之兔智来了这部动漫凭借其引人入胜的剧情和演员的精湛演技，受到众多观众追捧，一时间成了影迷圈常提及的话题。
